A equipe atua junto aos grupos e usuários, oferecendo uma infraestrutura computacional robusta para processamento de alto desempenho dos dados biológicos. A equipe realiza análises estatísticas avançadas, e aplica técnicas de visualização e métodos de bioinformática, aprendizado de máquina e inteligência artificial. O objetivo dessas abordagens é extrair conhecimento significativo de conjuntos de dados biológicos complexos e diversificados, como ômicas e bioimagens.

Equipamentos

  • Marvin (Cluster HPC):
    • 1 nó de processamento em GPU com: NVIDIA HDX 8x A100 40GB, 2TB RAM, 2x AMD EPYC 7742 (256 threads);
    • 1 nó de processamento em CPU com: 2x AMD EPYC 7742 (256 threads) e 1TB RAM;
    • 1 nó de login com NVIDIA A40 48GB para visualização;
    • Storage de altíssima performance: 300TB de capacidade, sistema de arquivo paralelo (Lustre), armazenamento em SSD NVMe.
  • Sonny (Cluster):
    • 3 nós de processamento com: AMD Ryzen 3950x (32 threads), 128GB RAM, 2x NVIDIA RTX 2080 8GB;
    • Storage 40TB.

Principais competências e técnicas

  • Desenvolvimento de algoritmos e protocolos de processamento de dados de alta performance;
  • Análise de dados com métodos avançados de estatística e aprendizado de máquina;
  • Desenvolvimento de ferramentas e serviços web para análise de dados;
  • Aplicação de técnicas de visualização de dados complexos;
  • Análise e integração de ômicas com métodos de bioinformática;
  • Administração, disponibilização, documentação e suporte da infraestrutura computacional de alta performance.

conheça nossa equipe

José Geraldo de Carvalho Pereira

Pesquisador adjunto

grupo de metodologias avançadas em biologia
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João Victor da Silva Guerra

Analista

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Pablo Wesley de Aguiar e Silva

Analista Jr.

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